29 октября (16) 1914 года Германия объявила войну России. В этот день, около 7 часов утра, возвращаясь с задания, в 14 милях от мыса Херсонес «Прут» встретил в море германский линейный крейсер "Гёбен". Крейсер поднял сигнал с предложением сдаться, ведь бой был неравным, т.к. тактико-технические характеристики крейсера «Гёбен» во много раз превышали ттх тихоходного минного заградителя: один снаряд крейсера весил 302 кг. А на минном заградителе «Прут» тогда находилась половина боевого запаса флота - 710 мин, часть из которых — новой конструкции — очень интересовало немецкое командоваине, да и попавшие в руки врага мины, были бы непременно употреблены против русского флота. И командир "Прута" капитан 2-го ранга Г. А. Быков приказал готовить корабль к затоплению. "Гёбен" обстрелял "Прут" из своих орудий и поджёг его. Команда открыла кингстоны и начала высаживаться на шлюпки. Когда судно стало погружаться, судовый священник иеромонах Антоний (Смирнов) уступил своё место на шлюпке матросу, а сам с тонущего корабля благословлял отплывающих матросов и погиб вместе с кораблём.
Примерно в 08 ч. 40 м. "Прут" встал почти вертикально и, с развевающимися на мачтах флагами, затонул в 10 милях к западу от мыса Фиолент.
Личный состав корабля пытался спастись на шлюпках, койках и спасательных поясах. Но часть его (3 офицера, в т. ч. командир, корабельный врач, 2 кондуктора и 69 матросов) была снята со шлюпки и поднята из воды турецкими миноносцами и взята в плен. Остальные (3 офицера и 199 матросов) были подняты на борт вышедшей из Балаклавы подводной лодки "Судак" и затем переданы на борт госпитального судна "Колхида", которое доставило их в Севастополь.
В бою погибли лейтенант Рогусский, мичман Смирнов, иеромонах Антоний, боцман Колюжный и 25 матросов.
За свой подвиг корабельный священник отец Антоний(ему было 70 лет) 4 ноября 1914 года был посмертно удостоен ордена святого Георгия 4-й степени, став первым русским военным и единственным флотским священником, удостоенным за годы Первой мировой войны этой высокой воинской награды.
В этот день были освящены четыре памятные гранитные плиты, установленные на северной стене транспета храма, на них золотыми буквами выгравированы описания героических эпизодов блистательной истории русского флота: в честь подвига сторжевого корабля «Бриз», совершившего 25 ноября 1941 года, в период Великой Отечественной войны, первый морской таран немецкой подводной лодки U-578 в Баренцевом море; в честь знаменательной победы парохода «Веста» над более мощным броненосным корветом «Фетхи-Буленд» 11 июля1877 года, во время русско-турецкой войны; экипаж парохода повторил подвиг легендарного брига «Меркурий» (14 мая 1829 года); в честь подвига минзага «Прут» и, отдельно — подвигу судового священника иеромонаха Антония (Смирнова).
После литии настоятель храма отправился на катере на место гибели минного заградителя «Прут», чтобы спустить поминальный венок на воду в память о погибших моряках первого погибшего судна первого дня Первой Мировой войны на траверсе мыса Херсонес.
В на территории нашего храма, справа от памятника свт. Николаю, есть якорь с погибшего минного заградителя "Прут": якорь был передан меценатами в дар нашему храму в 2017 году, освящён 31 октября 2018 года после торжественного молебна во славу русского флота, приуроченного к 104-ой годовщине со дня подвига "севастопльского Варяга" минного заградителя «Прут».